15 декабря 2002 г. – вуз преобразован в Федеральное государственное образовательное учреждение высшего профессионального образования «Астраханский государственный университет».
2004 г. – создана кафедра ЮНЕСКО «Обучающееся общество и устойчивое социально-экономическое развитие».
2007 г. – университет получает приз Рособрнадзора.
2008 г. – университет получает диплом лауреата конкурса «Национальный знак качества».
2010 г. – университет получает диплом лауреата Межрегионального конкурса «Лучшие вузы ЮФО – 2010».
2011 г. – университет становится институциональным членом международной организации TCI – Глобального института конкурентоспособности.
2012 г. – образован Инновационно-технологический центр агробиологии, информационных технологий и автоматизации.
2016 г. – ввод в эксплуатацию пристроя к учебному корпусу № 1 по ул. Татищева, 20а.